一、维持四川省雷波县人民法院（2019）川3437民初480号民事判决第二项，即“雷波凯瑞磷化工有限责任公司于本判决生效后20日内向石家庄新华能源环保科技股份有限公司返还缺陷责任保证金4000000.00元；”；

二、维持四川省雷波县人民法院（2019）川3437民初480号民事判决第三项，即“雷波凯瑞磷化工有限责任公司于本判决生效后20日内向石家庄新华能源环保科技股份有限公司返还履约保证金2000000.00元；”；

三、维持四川省雷波县人民法院（2019）川3437民初480号民事判决第四项，即“驳回石家庄新华能源环保科技股份有限公司其他诉讼请求；”；

四、维持四川省雷波县人民法院（2019）川3437民初480号民事判决第五项，即“驳回雷波凯瑞磷化工有限责任公司的反诉请求；”；

五、变更四川省雷波县人民法院（2019）川3437民初480号民事判决第一项“雷波凯瑞磷化工有限责任公司于本判决生效后20日内向石家庄新华能源环保科技股份有限公司支付工程款1044435.35元及利息（以1044435.35元为基数，自2017年9月15日起至实际付清之日止，按照中国人民银行同期贷款基准利率标准计算）；”内容为：“雷波凯瑞磷化工有限责任公司于本判决生效后20日内向石家庄新华能源环保科技股份有限公司支付工程款1044435.35元及利息（以1044435.35元为基数，自2017年9月15日起至2019年8月19日，按照中国人民银行发布的同期同类贷款利率计算；自2019年8月20日起至实际付清之日止，按照全国银行间同业拆借中心公布的同期贷款市场报价利率计算）。”

如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当按照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条之规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。

一审本诉案件受理费61111.00元，由雷波凯瑞磷化工有限责任公司负担；反诉案件受理费55900.00元，由雷波凯瑞磷化工有限责任公司负担。二审案件受理费61111.00元，由雷波凯磷化工有限责任公司负担。

本判决为终审判决。