一、被告北海中南房地产开发有限公司支付工程款36000元及利息损失（利息：以36000元为基数，按中国人民银行同期同类贷款利率，从2012年6月10日起计至还清之日止）给原告北海市建筑工程公司；

二、驳回原告北海市建筑工程公司的其他诉讼请求。

案件受理费7387元，原审鉴定费10000元，合计17386元，由原告负担16587元，被告负担案件受理费800元（该费用原告已向本院预交，被告应承担部分应在偿还上述款项时一并付还给原告）。

如不服本判决，可在本判决书送达之日起十五日内，向本院或广西壮族自治区北海市中级人民法院递交上诉状，按对方当事人人数提交副本，上诉于广西壮族自治区北海市中级人民法院，并于递交上诉状之日起至上诉期限届满后7日内预交上诉案件受理费7387元（收款单位广西壮族自治区北海市中级人民法院，帐号：455060600018120098416，开户银行：交通银行北海分行北部湾东路支行）。逾期不交也不提出缓交、减交、免交案件受理费申请的，按自动撤回上诉处理。