一、维持西安市中级人民法院（2018）陕01民初1298号民事判决第一、二、五项；

二、撤销西安市中级人民法院（2018）陕01民初1298号民事判决第三、四项；

三、驳回陕西世纪合辉医药有限公司其余诉讼请求。

如果未按本判决指定的期间履行给付金钱义务，应当依照《中华人民共和国民事诉讼法》第二百五十三条的规定，加倍支付迟延履行期间的债务利息。

一审本诉案件受理费170445元，由陕西世纪合辉医药有限公司负担153840元，由海南御生堂医药有限公司负担16605元。反诉案件受理费23928元，由海南御生堂医药有限公司负担。二审案件受理费114282元，由陕西世纪合辉医药有限公司负担58855元，由海南御生堂医药有限公司负担55427元。

本判决为终审判决。