ManBetX万博官方网站:世界上最濒危海龟物种海龟的高质量参考基因组序列
昆明,5月12日, (记者 胡元航)记者从中国科学院昆明动物研究所获悉,该研究所与长沙生态动物园合作,成功组装了世界上最濒危海龟物种海龟的高质量参考基因组序列,并分析了其适应性进化的基础。研究人员发现海龟与中国海龟密切相关,但在54.4百万年前开始分道扬镳。
图为斑鳖组装和比较分析图海龟是地球上最大的海龟物种,其背甲长度可达1.5米,体重可达115公斤。此外,海龟也是世界上最濒危的海龟物种。2019年初,世界上只有4只海龟(中国1雌1雄;越南2只,性别未知)。然而,令人遗憾的是,2019年4月13日,中国的雌性意外死亡(这是世界上唯一确定性别的雌性海龟)。
为了避免雌性海龟基因组遗传信息的永久丢失,促进海龟的调查和保护,在长沙生态动物园的支持下,研究人员在雌性死亡海龟的病理解剖检查过程中收集了个体的组织样本。结合相关测序数据,研究人员成功组装了个体染色体水平的高质量参考基因组序列。
龟龟类型后的基因差异图。研究人员基于各种数据集和系统发育树的构建算法,发现海龟与中国海龟密切相关,但在54.4数百万年前开始分道扬镳。种群历史分析表明,乌龟的有效群体在历史上呈现出持续下降的趋势,这与其遗传复杂性和遗传多样性较低是一致的。基因组学的比较分析表明,有些与自噬有关DNA损伤反应和生长相关过程的核心基因正在选择或快速进化,表明它们在海龟的长寿命和大体型过程中具有重要作用。此外,研究人员发现,与牙齿形成相关的一些基因在海龟基因组中缺失,这部分解释了它们的遗传基础。
图:对斑龟全基因组遗传信息的分析和分析,不仅为该物种保留了全基因组信息(尤其是雌性斑龟)ZW杂合子全基因组遗传信息),对未来斑龟的野外调查、搜索和保护具有重要意义。
相关研究成果最近发表在国际期刊上Molecular Ecology Resources上。(完)